В соответствии с пунктом 151 Распоряжения Правительства Российской Федерации от 09.02.2005 года №149-р ФГУП «НИИ «Вектор» было отнесено к ведению Федерального агентства по промышленности.
В связи с внесением Указом президента Российской Федерации от 12.05.2008 года №724 изменений в систему и структуру федеральных органов исполнительной власти, Федеральное агенство по промышленности было упразднено, его функции переданы Министерству промышленности и торговли Российской Федерации.
Постановлением Правительства Российской Федерации от 05.06.2008 года №428 утверждено Положение о Министерстве промышленности и торговли Российской Федерации.
На основании пункта 5.4 Постановления Правительства Российской Федерации от 05.06.2008 года №438 Министерство промышленности и торговли Российской Федерации осуществляет полномочия собственника в отношении федерального имущества, переданного федеральным унитарным предприятиям, в том числе ФГУП «НИИ «Вектор».
